Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms