Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG13O75143 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG13O75143 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms