Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC22O60826 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms