Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPAG9O60271 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPAG9O60271 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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