Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA2O43921 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA2O43921 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms