Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB2O43741 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms