Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DENRO43583 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DENRO43583 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DENRO43583 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms