Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms