Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACOX3O15254 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms