Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR1CO15160 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms