Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA8SH3BPF8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms