Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGB1P1B2RPK0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms