Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf51A6NDU8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C5orf51A6NDU8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms