Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RNF222A6NCQ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms