Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SNX13Q9Y5W8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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SNX13Q9Y5W8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SNX13Q9Y5W8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SNX13Q9Y5W8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX13Q9Y5W8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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