Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms