Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MED16Q9Y2X0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED16Q9Y2X0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms