Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF13BQ9Y275 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms