Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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TPCN1Q9ULQ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPCN1Q9ULQ1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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