Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF346Q9UL40 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms