Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms