Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms