Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms