Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF7Q9UBF6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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