Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms