Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms