Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXL2Q9NZ53 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms