Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R2Q9NY27 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms