Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A12Q9NXJ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms