Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO28Q9NVF7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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