Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms