Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGAP35Q9NRY4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP35Q9NRY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms