Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2B1Q9NRF2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms