Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPHNQ9NQX3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPHNQ9NQX3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms