Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms