Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BCAS3Q9H6U6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms