Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms