Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms