Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms