Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms