Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms