Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB2BQ9BVA1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms