Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms