Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERPUD2Q9BSE4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERPUD2Q9BSE4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms