Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMCHL2Q9BQD1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms