Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms