Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms