Protein–RNA interactions for Protein: Q99500

S1PR3, Sphingosine 1-phosphate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR3Q99500 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S1PR3Q99500 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S1PR3Q99500 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms