Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PFDN5Q99471 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms