Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRAMP1Q96RY5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRAMP1Q96RY5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms